Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CAPN12Q6ZSI9 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPN12Q6ZSI9 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms