Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms