Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRSAM1Q6UWE0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms