Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LETMD1Q6P1Q0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms