Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M0

SLC27A4, Long-chain fatty acid transport protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A4Q6P1M0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC27A4Q6P1M0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC27A4Q6P1M0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC27A4Q6P1M0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC27A4Q6P1M0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC27A4Q6P1M0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC27A4Q6P1M0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC27A4Q6P1M0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms