Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF544Q6NX49 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF544Q6NX49 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF544Q6NX49 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF544Q6NX49 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF544Q6NX49 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF544Q6NX49 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF544Q6NX49 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF544Q6NX49 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF544Q6NX49 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF544Q6NX49 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF544Q6NX49 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF544Q6NX49 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF544Q6NX49 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF544Q6NX49 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF544Q6NX49 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF544Q6NX49 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF544Q6NX49 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF544Q6NX49 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF544Q6NX49 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF544Q6NX49 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF544Q6NX49 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF544Q6NX49 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF544Q6NX49 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF544Q6NX49 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF544Q6NX49 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF544Q6NX49 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF544Q6NX49 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF544Q6NX49 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF544Q6NX49 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF544Q6NX49 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF544Q6NX49 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF544Q6NX49 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF544Q6NX49 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF544Q6NX49 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF544Q6NX49 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF544Q6NX49 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF544Q6NX49 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF544Q6NX49 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF544Q6NX49 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF544Q6NX49 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF544Q6NX49 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF544Q6NX49 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF544Q6NX49 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF544Q6NX49 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF544Q6NX49 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF544Q6NX49 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF544Q6NX49 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF544Q6NX49 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF544Q6NX49 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF544Q6NX49 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF544Q6NX49 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF544Q6NX49 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF544Q6NX49 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF544Q6NX49 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF544Q6NX49 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF544Q6NX49 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF544Q6NX49 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF544Q6NX49 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF544Q6NX49 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
ZNF544Q6NX49 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ZNF544Q6NX49 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ZNF544Q6NX49 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF544Q6NX49 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms