Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LRRC8EQ6NSJ5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms