Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
INTS3Q68E01 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
INTS3Q68E01 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
INTS3Q68E01 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
INTS3Q68E01 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
INTS3Q68E01 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
INTS3Q68E01 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
INTS3Q68E01 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
INTS3Q68E01 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
INTS3Q68E01 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
INTS3Q68E01 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
INTS3Q68E01 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
INTS3Q68E01 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
INTS3Q68E01 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
INTS3Q68E01 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
INTS3Q68E01 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
INTS3Q68E01 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
INTS3Q68E01 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
INTS3Q68E01 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
INTS3Q68E01 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
INTS3Q68E01 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
INTS3Q68E01 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
INTS3Q68E01 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
INTS3Q68E01 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
INTS3Q68E01 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
INTS3Q68E01 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
INTS3Q68E01 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
INTS3Q68E01 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
INTS3Q68E01 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
INTS3Q68E01 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
INTS3Q68E01 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
INTS3Q68E01 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
INTS3Q68E01 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
INTS3Q68E01 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
INTS3Q68E01 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
INTS3Q68E01 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
INTS3Q68E01 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
INTS3Q68E01 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
INTS3Q68E01 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
INTS3Q68E01 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
INTS3Q68E01 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
INTS3Q68E01 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
INTS3Q68E01 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
INTS3Q68E01 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
INTS3Q68E01 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
INTS3Q68E01 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
INTS3Q68E01 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
INTS3Q68E01 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
INTS3Q68E01 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
INTS3Q68E01 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
INTS3Q68E01 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
INTS3Q68E01 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
INTS3Q68E01 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
INTS3Q68E01 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
INTS3Q68E01 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
INTS3Q68E01 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
INTS3Q68E01 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
INTS3Q68E01 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
INTS3Q68E01 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
INTS3Q68E01 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
INTS3Q68E01 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
INTS3Q68E01 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
INTS3Q68E01 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
INTS3Q68E01 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
INTS3Q68E01 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
INTS3Q68E01 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
INTS3Q68E01 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
INTS3Q68E01 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
INTS3Q68E01 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
INTS3Q68E01 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
INTS3Q68E01 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
INTS3Q68E01 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
INTS3Q68E01 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
INTS3Q68E01 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
INTS3Q68E01 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
INTS3Q68E01 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
INTS3Q68E01 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
INTS3Q68E01 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
INTS3Q68E01 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
INTS3Q68E01 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
INTS3Q68E01 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
INTS3Q68E01 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
INTS3Q68E01 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
INTS3Q68E01 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
INTS3Q68E01 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
INTS3Q68E01 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
INTS3Q68E01 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
INTS3Q68E01 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
INTS3Q68E01 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
INTS3Q68E01 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
INTS3Q68E01 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
INTS3Q68E01 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
INTS3Q68E01 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
INTS3Q68E01 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
INTS3Q68E01 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
INTS3Q68E01 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
INTS3Q68E01 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
INTS3Q68E01 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
INTS3Q68E01 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
INTS3Q68E01 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms