Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV17

OTUD1, OTU domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD1Q5VV17 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
OTUD1Q5VV17 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
OTUD1Q5VV17 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
OTUD1Q5VV17 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
OTUD1Q5VV17 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
OTUD1Q5VV17 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
OTUD1Q5VV17 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
OTUD1Q5VV17 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
OTUD1Q5VV17 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
OTUD1Q5VV17 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
OTUD1Q5VV17 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
OTUD1Q5VV17 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
OTUD1Q5VV17 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
OTUD1Q5VV17 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
OTUD1Q5VV17 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
OTUD1Q5VV17 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
OTUD1Q5VV17 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
OTUD1Q5VV17 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTUD1Q5VV17 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTUD1Q5VV17 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTUD1Q5VV17 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTUD1Q5VV17 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTUD1Q5VV17 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTUD1Q5VV17 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTUD1Q5VV17 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
OTUD1Q5VV17 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTUD1Q5VV17 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTUD1Q5VV17 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTUD1Q5VV17 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTUD1Q5VV17 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTUD1Q5VV17 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
OTUD1Q5VV17 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTUD1Q5VV17 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTUD1Q5VV17 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
OTUD1Q5VV17 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTUD1Q5VV17 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
OTUD1Q5VV17 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
OTUD1Q5VV17 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
OTUD1Q5VV17 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
OTUD1Q5VV17 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
OTUD1Q5VV17 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
OTUD1Q5VV17 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
OTUD1Q5VV17 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
OTUD1Q5VV17 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
OTUD1Q5VV17 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
OTUD1Q5VV17 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
OTUD1Q5VV17 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
OTUD1Q5VV17 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
OTUD1Q5VV17 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
OTUD1Q5VV17 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
OTUD1Q5VV17 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
OTUD1Q5VV17 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
OTUD1Q5VV17 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
OTUD1Q5VV17 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
OTUD1Q5VV17 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
OTUD1Q5VV17 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
OTUD1Q5VV17 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
OTUD1Q5VV17 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
OTUD1Q5VV17 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
OTUD1Q5VV17 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
OTUD1Q5VV17 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
OTUD1Q5VV17 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
OTUD1Q5VV17 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
OTUD1Q5VV17 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
OTUD1Q5VV17 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
OTUD1Q5VV17 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
OTUD1Q5VV17 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OTUD1Q5VV17 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OTUD1Q5VV17 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OTUD1Q5VV17 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OTUD1Q5VV17 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OTUD1Q5VV17 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OTUD1Q5VV17 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OTUD1Q5VV17 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OTUD1Q5VV17 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OTUD1Q5VV17 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
OTUD1Q5VV17 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
OTUD1Q5VV17 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OTUD1Q5VV17 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OTUD1Q5VV17 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OTUD1Q5VV17 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OTUD1Q5VV17 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OTUD1Q5VV17 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OTUD1Q5VV17 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OTUD1Q5VV17 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
OTUD1Q5VV17 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
OTUD1Q5VV17 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
OTUD1Q5VV17 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
OTUD1Q5VV17 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OTUD1Q5VV17 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
OTUD1Q5VV17 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
OTUD1Q5VV17 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OTUD1Q5VV17 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OTUD1Q5VV17 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OTUD1Q5VV17 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
OTUD1Q5VV17 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
OTUD1Q5VV17 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
OTUD1Q5VV17 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
OTUD1Q5VV17 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
OTUD1Q5VV17 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms