Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTD9

GFI1B, Zinc finger protein Gfi-1b, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1BQ5VTD9 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GFI1BQ5VTD9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GFI1BQ5VTD9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GFI1BQ5VTD9 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GFI1BQ5VTD9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GFI1BQ5VTD9 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GFI1BQ5VTD9 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GFI1BQ5VTD9 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GFI1BQ5VTD9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GFI1BQ5VTD9 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GFI1BQ5VTD9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GFI1BQ5VTD9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GFI1BQ5VTD9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GFI1BQ5VTD9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GFI1BQ5VTD9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GFI1BQ5VTD9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GFI1BQ5VTD9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GFI1BQ5VTD9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GFI1BQ5VTD9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GFI1BQ5VTD9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GFI1BQ5VTD9 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GFI1BQ5VTD9 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GFI1BQ5VTD9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GFI1BQ5VTD9 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GFI1BQ5VTD9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GFI1BQ5VTD9 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GFI1BQ5VTD9 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GFI1BQ5VTD9 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GFI1BQ5VTD9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GFI1BQ5VTD9 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GFI1BQ5VTD9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GFI1BQ5VTD9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GFI1BQ5VTD9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GFI1BQ5VTD9 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GFI1BQ5VTD9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GFI1BQ5VTD9 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GFI1BQ5VTD9 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GFI1BQ5VTD9 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GFI1BQ5VTD9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GFI1BQ5VTD9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GFI1BQ5VTD9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GFI1BQ5VTD9 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GFI1BQ5VTD9 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GFI1BQ5VTD9 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GFI1BQ5VTD9 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GFI1BQ5VTD9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GFI1BQ5VTD9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GFI1BQ5VTD9 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GFI1BQ5VTD9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GFI1BQ5VTD9 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GFI1BQ5VTD9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GFI1BQ5VTD9 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GFI1BQ5VTD9 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GFI1BQ5VTD9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GFI1BQ5VTD9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GFI1BQ5VTD9 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GFI1BQ5VTD9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GFI1BQ5VTD9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GFI1BQ5VTD9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GFI1BQ5VTD9 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GFI1BQ5VTD9 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GFI1BQ5VTD9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GFI1BQ5VTD9 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GFI1BQ5VTD9 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GFI1BQ5VTD9 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GFI1BQ5VTD9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GFI1BQ5VTD9 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GFI1BQ5VTD9 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GFI1BQ5VTD9 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GFI1BQ5VTD9 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GFI1BQ5VTD9 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GFI1BQ5VTD9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
GFI1BQ5VTD9 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GFI1BQ5VTD9 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GFI1BQ5VTD9 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GFI1BQ5VTD9 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GFI1BQ5VTD9 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GFI1BQ5VTD9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GFI1BQ5VTD9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GFI1BQ5VTD9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GFI1BQ5VTD9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GFI1BQ5VTD9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GFI1BQ5VTD9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GFI1BQ5VTD9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GFI1BQ5VTD9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GFI1BQ5VTD9 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GFI1BQ5VTD9 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GFI1BQ5VTD9 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GFI1BQ5VTD9 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GFI1BQ5VTD9 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GFI1BQ5VTD9 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GFI1BQ5VTD9 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GFI1BQ5VTD9 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GFI1BQ5VTD9 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GFI1BQ5VTD9 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GFI1BQ5VTD9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GFI1BQ5VTD9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GFI1BQ5VTD9 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GFI1BQ5VTD9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GFI1BQ5VTD9 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms