Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTB9

RNF220, E3 ubiquitin-protein ligase RNF220, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220Q5VTB9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms