Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

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Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC38Q5VT99 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC38Q5VT99 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC38Q5VT99 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC38Q5VT99 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC38Q5VT99 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC38Q5VT99 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC38Q5VT99 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC38Q5VT99 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC38Q5VT99 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC38Q5VT99 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC38Q5VT99 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC38Q5VT99 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC38Q5VT99 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC38Q5VT99 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC38Q5VT99 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC38Q5VT99 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC38Q5VT99 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC38Q5VT99 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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LRRC38Q5VT99 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC38Q5VT99 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC38Q5VT99 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC38Q5VT99 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC38Q5VT99 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC38Q5VT99 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC38Q5VT99 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC38Q5VT99 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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LRRC38Q5VT99 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC38Q5VT99 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC38Q5VT99 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC38Q5VT99 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC38Q5VT99 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC38Q5VT99 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC38Q5VT99 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC38Q5VT99 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC38Q5VT99 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC38Q5VT99 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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LRRC38Q5VT99 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
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LRRC38Q5VT99 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC38Q5VT99 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC38Q5VT99 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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LRRC38Q5VT99 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC38Q5VT99 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC38Q5VT99 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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LRRC38Q5VT99 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC38Q5VT99 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC38Q5VT99 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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LRRC38Q5VT99 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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LRRC38Q5VT99 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
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LRRC38Q5VT99 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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LRRC38Q5VT99 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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LRRC38Q5VT99 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC38Q5VT99 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC38Q5VT99 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC38Q5VT99 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC38Q5VT99 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC38Q5VT99 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC38Q5VT99 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC38Q5VT99 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC38Q5VT99 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC38Q5VT99 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC38Q5VT99 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC38Q5VT99 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC38Q5VT99 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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LRRC38Q5VT99 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC38Q5VT99 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC38Q5VT99 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC38Q5VT99 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC38Q5VT99 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC38Q5VT99 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC38Q5VT99 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC38Q5VT99 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC38Q5VT99 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC38Q5VT99 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
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