Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HES3Q5TGS1 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms