Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2N8

ATAD3C, ATPase family AAA domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3CQ5T2N8 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms