Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
COL5A1-AS1Q5SY13 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COL5A1-AS1Q5SY13 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL5A1-AS1Q5SY13 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COL5A1-AS1Q5SY13 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL5A1-AS1Q5SY13 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COL5A1-AS1Q5SY13 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COL5A1-AS1Q5SY13 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL5A1-AS1Q5SY13 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL5A1-AS1Q5SY13 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL5A1-AS1Q5SY13 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL5A1-AS1Q5SY13 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL5A1-AS1Q5SY13 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COL5A1-AS1Q5SY13 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COL5A1-AS1Q5SY13 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COL5A1-AS1Q5SY13 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COL5A1-AS1Q5SY13 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC15.08■□□□□ 0
COL5A1-AS1Q5SY13 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COL5A1-AS1Q5SY13 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
COL5A1-AS1Q5SY13 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL5A1-AS1Q5SY13 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL5A1-AS1Q5SY13 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL5A1-AS1Q5SY13 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL5A1-AS1Q5SY13 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL5A1-AS1Q5SY13 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL5A1-AS1Q5SY13 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COL5A1-AS1Q5SY13 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL5A1-AS1Q5SY13 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL5A1-AS1Q5SY13 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL5A1-AS1Q5SY13 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL5A1-AS1Q5SY13 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COL5A1-AS1Q5SY13 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COL5A1-AS1Q5SY13 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.07■□□□□ 0
COL5A1-AS1Q5SY13 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL5A1-AS1Q5SY13 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL5A1-AS1Q5SY13 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL5A1-AS1Q5SY13 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COL5A1-AS1Q5SY13 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL5A1-AS1Q5SY13 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
COL5A1-AS1Q5SY13 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
COL5A1-AS1Q5SY13 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COL5A1-AS1Q5SY13 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL5A1-AS1Q5SY13 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL5A1-AS1Q5SY13 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
COL5A1-AS1Q5SY13 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
COL5A1-AS1Q5SY13 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL5A1-AS1Q5SY13 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL5A1-AS1Q5SY13 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COL5A1-AS1Q5SY13 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
COL5A1-AS1Q5SY13 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL5A1-AS1Q5SY13 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms