Protein–RNA interactions for Protein: Q5RGS3

FAM74A1, Protein FAM74A1, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM74A1Q5RGS3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM74A1Q5RGS3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM74A1Q5RGS3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM74A1Q5RGS3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM74A1Q5RGS3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM74A1Q5RGS3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM74A1Q5RGS3 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM74A1Q5RGS3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM74A1Q5RGS3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM74A1Q5RGS3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM74A1Q5RGS3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM74A1Q5RGS3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM74A1Q5RGS3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM74A1Q5RGS3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM74A1Q5RGS3 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM74A1Q5RGS3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM74A1Q5RGS3 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM74A1Q5RGS3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM74A1Q5RGS3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM74A1Q5RGS3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM74A1Q5RGS3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM74A1Q5RGS3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM74A1Q5RGS3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM74A1Q5RGS3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM74A1Q5RGS3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM74A1Q5RGS3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM74A1Q5RGS3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM74A1Q5RGS3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM74A1Q5RGS3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM74A1Q5RGS3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM74A1Q5RGS3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM74A1Q5RGS3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM74A1Q5RGS3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM74A1Q5RGS3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM74A1Q5RGS3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM74A1Q5RGS3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM74A1Q5RGS3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM74A1Q5RGS3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM74A1Q5RGS3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM74A1Q5RGS3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM74A1Q5RGS3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM74A1Q5RGS3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM74A1Q5RGS3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM74A1Q5RGS3 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM74A1Q5RGS3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM74A1Q5RGS3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM74A1Q5RGS3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM74A1Q5RGS3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM74A1Q5RGS3 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM74A1Q5RGS3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM74A1Q5RGS3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM74A1Q5RGS3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM74A1Q5RGS3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM74A1Q5RGS3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM74A1Q5RGS3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM74A1Q5RGS3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM74A1Q5RGS3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM74A1Q5RGS3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM74A1Q5RGS3 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM74A1Q5RGS3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM74A1Q5RGS3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM74A1Q5RGS3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM74A1Q5RGS3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM74A1Q5RGS3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM74A1Q5RGS3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM74A1Q5RGS3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM74A1Q5RGS3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM74A1Q5RGS3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM74A1Q5RGS3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM74A1Q5RGS3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM74A1Q5RGS3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM74A1Q5RGS3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM74A1Q5RGS3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM74A1Q5RGS3 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM74A1Q5RGS3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM74A1Q5RGS3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM74A1Q5RGS3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM74A1Q5RGS3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM74A1Q5RGS3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM74A1Q5RGS3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM74A1Q5RGS3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM74A1Q5RGS3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM74A1Q5RGS3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM74A1Q5RGS3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM74A1Q5RGS3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM74A1Q5RGS3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM74A1Q5RGS3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM74A1Q5RGS3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM74A1Q5RGS3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM74A1Q5RGS3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM74A1Q5RGS3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM74A1Q5RGS3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM74A1Q5RGS3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM74A1Q5RGS3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM74A1Q5RGS3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM74A1Q5RGS3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM74A1Q5RGS3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM74A1Q5RGS3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM74A1Q5RGS3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM74A1Q5RGS3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms