Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
KCNT1Q5JUK3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KCNT1Q5JUK3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNT1Q5JUK3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNT1Q5JUK3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNT1Q5JUK3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNT1Q5JUK3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNT1Q5JUK3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNT1Q5JUK3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNT1Q5JUK3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNT1Q5JUK3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNT1Q5JUK3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNT1Q5JUK3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNT1Q5JUK3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNT1Q5JUK3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNT1Q5JUK3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNT1Q5JUK3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNT1Q5JUK3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNT1Q5JUK3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNT1Q5JUK3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNT1Q5JUK3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNT1Q5JUK3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNT1Q5JUK3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNT1Q5JUK3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNT1Q5JUK3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNT1Q5JUK3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNT1Q5JUK3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNT1Q5JUK3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNT1Q5JUK3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNT1Q5JUK3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNT1Q5JUK3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNT1Q5JUK3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNT1Q5JUK3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNT1Q5JUK3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNT1Q5JUK3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNT1Q5JUK3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNT1Q5JUK3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNT1Q5JUK3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNT1Q5JUK3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNT1Q5JUK3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNT1Q5JUK3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNT1Q5JUK3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNT1Q5JUK3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNT1Q5JUK3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNT1Q5JUK3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNT1Q5JUK3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNT1Q5JUK3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNT1Q5JUK3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNT1Q5JUK3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNT1Q5JUK3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNT1Q5JUK3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNT1Q5JUK3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNT1Q5JUK3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNT1Q5JUK3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNT1Q5JUK3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNT1Q5JUK3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNT1Q5JUK3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNT1Q5JUK3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNT1Q5JUK3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNT1Q5JUK3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNT1Q5JUK3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNT1Q5JUK3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNT1Q5JUK3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNT1Q5JUK3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNT1Q5JUK3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNT1Q5JUK3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNT1Q5JUK3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNT1Q5JUK3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNT1Q5JUK3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNT1Q5JUK3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNT1Q5JUK3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNT1Q5JUK3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNT1Q5JUK3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNT1Q5JUK3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNT1Q5JUK3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNT1Q5JUK3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNT1Q5JUK3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNT1Q5JUK3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNT1Q5JUK3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNT1Q5JUK3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms