Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms