Protein–RNA interactions for Protein: Q53GD3

SLC44A4, Choline transporter-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A4Q53GD3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC44A4Q53GD3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms