Protein–RNA interactions for Protein: Q53FD0

ZC2HC1C, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC2HC1CQ53FD0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZC2HC1CQ53FD0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZC2HC1CQ53FD0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZC2HC1CQ53FD0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZC2HC1CQ53FD0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ZC2HC1CQ53FD0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZC2HC1CQ53FD0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ZC2HC1CQ53FD0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZC2HC1CQ53FD0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ZC2HC1CQ53FD0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZC2HC1CQ53FD0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZC2HC1CQ53FD0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZC2HC1CQ53FD0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZC2HC1CQ53FD0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZC2HC1CQ53FD0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZC2HC1CQ53FD0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZC2HC1CQ53FD0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZC2HC1CQ53FD0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZC2HC1CQ53FD0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZC2HC1CQ53FD0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZC2HC1CQ53FD0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZC2HC1CQ53FD0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZC2HC1CQ53FD0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZC2HC1CQ53FD0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZC2HC1CQ53FD0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZC2HC1CQ53FD0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZC2HC1CQ53FD0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ZC2HC1CQ53FD0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZC2HC1CQ53FD0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZC2HC1CQ53FD0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZC2HC1CQ53FD0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZC2HC1CQ53FD0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZC2HC1CQ53FD0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZC2HC1CQ53FD0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ZC2HC1CQ53FD0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZC2HC1CQ53FD0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZC2HC1CQ53FD0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ZC2HC1CQ53FD0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZC2HC1CQ53FD0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZC2HC1CQ53FD0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ZC2HC1CQ53FD0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZC2HC1CQ53FD0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZC2HC1CQ53FD0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZC2HC1CQ53FD0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZC2HC1CQ53FD0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ZC2HC1CQ53FD0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZC2HC1CQ53FD0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZC2HC1CQ53FD0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZC2HC1CQ53FD0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZC2HC1CQ53FD0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZC2HC1CQ53FD0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZC2HC1CQ53FD0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZC2HC1CQ53FD0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ZC2HC1CQ53FD0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZC2HC1CQ53FD0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ZC2HC1CQ53FD0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZC2HC1CQ53FD0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZC2HC1CQ53FD0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZC2HC1CQ53FD0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZC2HC1CQ53FD0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZC2HC1CQ53FD0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZC2HC1CQ53FD0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZC2HC1CQ53FD0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZC2HC1CQ53FD0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZC2HC1CQ53FD0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZC2HC1CQ53FD0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZC2HC1CQ53FD0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZC2HC1CQ53FD0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZC2HC1CQ53FD0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZC2HC1CQ53FD0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZC2HC1CQ53FD0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZC2HC1CQ53FD0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZC2HC1CQ53FD0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZC2HC1CQ53FD0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZC2HC1CQ53FD0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZC2HC1CQ53FD0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZC2HC1CQ53FD0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZC2HC1CQ53FD0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZC2HC1CQ53FD0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZC2HC1CQ53FD0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZC2HC1CQ53FD0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZC2HC1CQ53FD0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZC2HC1CQ53FD0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZC2HC1CQ53FD0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZC2HC1CQ53FD0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZC2HC1CQ53FD0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ZC2HC1CQ53FD0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZC2HC1CQ53FD0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZC2HC1CQ53FD0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZC2HC1CQ53FD0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZC2HC1CQ53FD0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZC2HC1CQ53FD0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZC2HC1CQ53FD0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZC2HC1CQ53FD0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZC2HC1CQ53FD0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZC2HC1CQ53FD0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZC2HC1CQ53FD0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZC2HC1CQ53FD0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZC2HC1CQ53FD0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZC2HC1CQ53FD0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.2 ms