Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC153Q494R4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms