Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPK5

CTU2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2Q2VPK5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTU2Q2VPK5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTU2Q2VPK5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTU2Q2VPK5 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CTU2Q2VPK5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CTU2Q2VPK5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CTU2Q2VPK5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CTU2Q2VPK5 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CTU2Q2VPK5 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CTU2Q2VPK5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTU2Q2VPK5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms