Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP6V1FQ16864 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP6V1FQ16864 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP6V1FQ16864 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP6V1FQ16864 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP6V1FQ16864 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP6V1FQ16864 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP6V1FQ16864 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP6V1FQ16864 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP6V1FQ16864 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP6V1FQ16864 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP6V1FQ16864 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP6V1FQ16864 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP6V1FQ16864 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP6V1FQ16864 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP6V1FQ16864 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP6V1FQ16864 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP6V1FQ16864 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP6V1FQ16864 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP6V1FQ16864 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP6V1FQ16864 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP6V1FQ16864 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP6V1FQ16864 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP6V1FQ16864 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP6V1FQ16864 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP6V1FQ16864 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP6V1FQ16864 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP6V1FQ16864 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP6V1FQ16864 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP6V1FQ16864 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP6V1FQ16864 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP6V1FQ16864 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP6V1FQ16864 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP6V1FQ16864 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP6V1FQ16864 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP6V1FQ16864 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP6V1FQ16864 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP6V1FQ16864 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP6V1FQ16864 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP6V1FQ16864 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP6V1FQ16864 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP6V1FQ16864 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP6V1FQ16864 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP6V1FQ16864 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP6V1FQ16864 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP6V1FQ16864 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP6V1FQ16864 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP6V1FQ16864 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP6V1FQ16864 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP6V1FQ16864 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP6V1FQ16864 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP6V1FQ16864 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP6V1FQ16864 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP6V1FQ16864 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP6V1FQ16864 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP6V1FQ16864 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP6V1FQ16864 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP6V1FQ16864 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP6V1FQ16864 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP6V1FQ16864 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP6V1FQ16864 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP6V1FQ16864 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP6V1FQ16864 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP6V1FQ16864 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP6V1FQ16864 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP6V1FQ16864 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP6V1FQ16864 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP6V1FQ16864 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP6V1FQ16864 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP6V1FQ16864 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP6V1FQ16864 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP6V1FQ16864 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP6V1FQ16864 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP6V1FQ16864 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP6V1FQ16864 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP6V1FQ16864 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP6V1FQ16864 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP6V1FQ16864 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP6V1FQ16864 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP6V1FQ16864 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP6V1FQ16864 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP6V1FQ16864 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP6V1FQ16864 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP6V1FQ16864 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP6V1FQ16864 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP6V1FQ16864 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP6V1FQ16864 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP6V1FQ16864 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP6V1FQ16864 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP6V1FQ16864 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP6V1FQ16864 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP6V1FQ16864 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP6V1FQ16864 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP6V1FQ16864 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP6V1FQ16864 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP6V1FQ16864 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP6V1FQ16864 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP6V1FQ16864 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP6V1FQ16864 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP6V1FQ16864 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms