Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RBBP7Q16576 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RBBP7Q16576 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RBBP7Q16576 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RBBP7Q16576 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
RBBP7Q16576 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RBBP7Q16576 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RBBP7Q16576 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RBBP7Q16576 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RBBP7Q16576 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RBBP7Q16576 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RBBP7Q16576 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RBBP7Q16576 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RBBP7Q16576 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RBBP7Q16576 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RBBP7Q16576 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
RBBP7Q16576 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RBBP7Q16576 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RBBP7Q16576 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RBBP7Q16576 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RBBP7Q16576 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBBP7Q16576 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBBP7Q16576 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBBP7Q16576 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBBP7Q16576 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBBP7Q16576 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBBP7Q16576 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBBP7Q16576 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBBP7Q16576 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
RBBP7Q16576 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBBP7Q16576 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBBP7Q16576 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBBP7Q16576 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBBP7Q16576 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
RBBP7Q16576 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBBP7Q16576 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBBP7Q16576 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBBP7Q16576 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBBP7Q16576 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBBP7Q16576 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBBP7Q16576 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBBP7Q16576 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBBP7Q16576 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBBP7Q16576 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBBP7Q16576 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RBBP7Q16576 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
RBBP7Q16576 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RBBP7Q16576 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RBBP7Q16576 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBBP7Q16576 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
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