Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNAPC1Q16533 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
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