Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDB1Q16531 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
DDB1Q16531 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDB1Q16531 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDB1Q16531 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDB1Q16531 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDB1Q16531 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDB1Q16531 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
DDB1Q16531 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDB1Q16531 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDB1Q16531 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDB1Q16531 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
DDB1Q16531 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDB1Q16531 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDB1Q16531 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDB1Q16531 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDB1Q16531 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDB1Q16531 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDB1Q16531 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDB1Q16531 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDB1Q16531 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDB1Q16531 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDB1Q16531 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDB1Q16531 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDB1Q16531 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDB1Q16531 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDB1Q16531 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDB1Q16531 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDB1Q16531 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDB1Q16531 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDB1Q16531 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDB1Q16531 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDB1Q16531 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
DDB1Q16531 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDB1Q16531 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDB1Q16531 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDB1Q16531 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDB1Q16531 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDB1Q16531 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDB1Q16531 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
DDB1Q16531 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDB1Q16531 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDB1Q16531 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDB1Q16531 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDB1Q16531 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
DDB1Q16531 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
DDB1Q16531 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDB1Q16531 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDB1Q16531 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDB1Q16531 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDB1Q16531 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDB1Q16531 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDB1Q16531 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDB1Q16531 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDB1Q16531 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDB1Q16531 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDB1Q16531 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDB1Q16531 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDB1Q16531 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
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DDB1Q16531 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDB1Q16531 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDB1Q16531 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDB1Q16531 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDB1Q16531 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDB1Q16531 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
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DDB1Q16531 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
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DDB1Q16531 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDB1Q16531 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
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DDB1Q16531 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
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DDB1Q16531 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDB1Q16531 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
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DDB1Q16531 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDB1Q16531 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDB1Q16531 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDB1Q16531 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDB1Q16531 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
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DDB1Q16531 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
DDB1Q16531 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
DDB1Q16531 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDB1Q16531 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDB1Q16531 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDB1Q16531 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDB1Q16531 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDB1Q16531 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDB1Q16531 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDB1Q16531 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDB1Q16531 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDB1Q16531 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
DDB1Q16531 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDB1Q16531 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDB1Q16531 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
DDB1Q16531 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
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