Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NPTX1Q15818 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
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