Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SF1Q15637 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SF1Q15637 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SF1Q15637 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SF1Q15637 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SF1Q15637 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SF1Q15637 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SF1Q15637 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SF1Q15637 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SF1Q15637 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SF1Q15637 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SF1Q15637 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SF1Q15637 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SF1Q15637 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SF1Q15637 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SF1Q15637 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SF1Q15637 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SF1Q15637 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SF1Q15637 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SF1Q15637 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SF1Q15637 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SF1Q15637 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SF1Q15637 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SF1Q15637 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SF1Q15637 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SF1Q15637 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SF1Q15637 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SF1Q15637 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SF1Q15637 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SF1Q15637 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SF1Q15637 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SF1Q15637 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SF1Q15637 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SF1Q15637 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SF1Q15637 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SF1Q15637 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SF1Q15637 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SF1Q15637 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SF1Q15637 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SF1Q15637 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SF1Q15637 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
SF1Q15637 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SF1Q15637 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SF1Q15637 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SF1Q15637 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SF1Q15637 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SF1Q15637 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SF1Q15637 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SF1Q15637 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SF1Q15637 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SF1Q15637 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SF1Q15637 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SF1Q15637 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SF1Q15637 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SF1Q15637 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SF1Q15637 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SF1Q15637 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SF1Q15637 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SF1Q15637 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SF1Q15637 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SF1Q15637 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SF1Q15637 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SF1Q15637 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SF1Q15637 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SF1Q15637 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SF1Q15637 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SF1Q15637 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SF1Q15637 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SF1Q15637 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SF1Q15637 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SF1Q15637 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SF1Q15637 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SF1Q15637 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SF1Q15637 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SF1Q15637 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SF1Q15637 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SF1Q15637 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SF1Q15637 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SF1Q15637 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SF1Q15637 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SF1Q15637 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SF1Q15637 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SF1Q15637 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SF1Q15637 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SF1Q15637 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SF1Q15637 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SF1Q15637 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SF1Q15637 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SF1Q15637 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SF1Q15637 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SF1Q15637 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SF1Q15637 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SF1Q15637 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SF1Q15637 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SF1Q15637 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SF1Q15637 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SF1Q15637 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SF1Q15637 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SF1Q15637 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SF1Q15637 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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