Protein–RNA interactions for Protein: Q15435

PPP1R7, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R7Q15435 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPP1R7Q15435 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPP1R7Q15435 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPP1R7Q15435 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPP1R7Q15435 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms