Protein–RNA interactions for Protein: Q15406

NR6A1, Nuclear receptor subfamily 6 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR6A1Q15406 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NR6A1Q15406 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NR6A1Q15406 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NR6A1Q15406 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NR6A1Q15406 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NR6A1Q15406 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NR6A1Q15406 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NR6A1Q15406 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NR6A1Q15406 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NR6A1Q15406 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NR6A1Q15406 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NR6A1Q15406 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NR6A1Q15406 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NR6A1Q15406 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NR6A1Q15406 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NR6A1Q15406 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NR6A1Q15406 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NR6A1Q15406 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NR6A1Q15406 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NR6A1Q15406 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NR6A1Q15406 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NR6A1Q15406 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NR6A1Q15406 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NR6A1Q15406 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NR6A1Q15406 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NR6A1Q15406 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NR6A1Q15406 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NR6A1Q15406 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NR6A1Q15406 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NR6A1Q15406 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NR6A1Q15406 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NR6A1Q15406 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NR6A1Q15406 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NR6A1Q15406 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NR6A1Q15406 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NR6A1Q15406 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NR6A1Q15406 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NR6A1Q15406 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NR6A1Q15406 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NR6A1Q15406 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NR6A1Q15406 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NR6A1Q15406 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NR6A1Q15406 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NR6A1Q15406 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NR6A1Q15406 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NR6A1Q15406 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NR6A1Q15406 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NR6A1Q15406 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NR6A1Q15406 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NR6A1Q15406 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NR6A1Q15406 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NR6A1Q15406 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NR6A1Q15406 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NR6A1Q15406 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NR6A1Q15406 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NR6A1Q15406 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NR6A1Q15406 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NR6A1Q15406 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NR6A1Q15406 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NR6A1Q15406 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NR6A1Q15406 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NR6A1Q15406 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NR6A1Q15406 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NR6A1Q15406 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NR6A1Q15406 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NR6A1Q15406 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NR6A1Q15406 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NR6A1Q15406 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NR6A1Q15406 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NR6A1Q15406 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NR6A1Q15406 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NR6A1Q15406 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NR6A1Q15406 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NR6A1Q15406 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NR6A1Q15406 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NR6A1Q15406 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NR6A1Q15406 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NR6A1Q15406 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NR6A1Q15406 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NR6A1Q15406 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NR6A1Q15406 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NR6A1Q15406 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NR6A1Q15406 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NR6A1Q15406 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NR6A1Q15406 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NR6A1Q15406 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NR6A1Q15406 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NR6A1Q15406 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NR6A1Q15406 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NR6A1Q15406 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NR6A1Q15406 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NR6A1Q15406 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NR6A1Q15406 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NR6A1Q15406 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NR6A1Q15406 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NR6A1Q15406 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NR6A1Q15406 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NR6A1Q15406 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NR6A1Q15406 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NR6A1Q15406 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms