Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDK1Q15118 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDK1Q15118 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDK1Q15118 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDK1Q15118 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDK1Q15118 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDK1Q15118 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDK1Q15118 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PDK1Q15118 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDK1Q15118 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDK1Q15118 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDK1Q15118 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDK1Q15118 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDK1Q15118 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDK1Q15118 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDK1Q15118 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDK1Q15118 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PDK1Q15118 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDK1Q15118 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDK1Q15118 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDK1Q15118 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDK1Q15118 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PDK1Q15118 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDK1Q15118 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDK1Q15118 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDK1Q15118 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDK1Q15118 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDK1Q15118 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDK1Q15118 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDK1Q15118 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDK1Q15118 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDK1Q15118 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDK1Q15118 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDK1Q15118 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDK1Q15118 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDK1Q15118 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDK1Q15118 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDK1Q15118 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDK1Q15118 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDK1Q15118 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PDK1Q15118 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDK1Q15118 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDK1Q15118 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDK1Q15118 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDK1Q15118 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDK1Q15118 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDK1Q15118 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PDK1Q15118 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDK1Q15118 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDK1Q15118 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDK1Q15118 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PDK1Q15118 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PDK1Q15118 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDK1Q15118 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDK1Q15118 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDK1Q15118 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDK1Q15118 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDK1Q15118 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDK1Q15118 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDK1Q15118 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDK1Q15118 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDK1Q15118 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDK1Q15118 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDK1Q15118 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDK1Q15118 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDK1Q15118 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDK1Q15118 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDK1Q15118 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDK1Q15118 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PDK1Q15118 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDK1Q15118 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDK1Q15118 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDK1Q15118 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDK1Q15118 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDK1Q15118 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDK1Q15118 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDK1Q15118 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDK1Q15118 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDK1Q15118 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDK1Q15118 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDK1Q15118 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDK1Q15118 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDK1Q15118 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDK1Q15118 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDK1Q15118 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDK1Q15118 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDK1Q15118 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDK1Q15118 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDK1Q15118 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDK1Q15118 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDK1Q15118 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDK1Q15118 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDK1Q15118 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDK1Q15118 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDK1Q15118 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDK1Q15118 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDK1Q15118 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDK1Q15118 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDK1Q15118 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDK1Q15118 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms