Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DNASE1L3Q13609 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DNASE1L3Q13609 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DNASE1L3Q13609 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DNASE1L3Q13609 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DNASE1L3Q13609 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
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