Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF4BQ13523 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
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PRPF4BQ13523 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF4BQ13523 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPF4BQ13523 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
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