Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMED1Q13445 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TMED1Q13445 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TMED1Q13445 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TMED1Q13445 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TMED1Q13445 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMED1Q13445 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMED1Q13445 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMED1Q13445 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMED1Q13445 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMED1Q13445 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMED1Q13445 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMED1Q13445 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMED1Q13445 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMED1Q13445 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMED1Q13445 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMED1Q13445 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMED1Q13445 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMED1Q13445 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMED1Q13445 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMED1Q13445 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMED1Q13445 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMED1Q13445 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMED1Q13445 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMED1Q13445 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMED1Q13445 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMED1Q13445 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMED1Q13445 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMED1Q13445 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMED1Q13445 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMED1Q13445 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMED1Q13445 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMED1Q13445 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMED1Q13445 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMED1Q13445 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMED1Q13445 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMED1Q13445 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMED1Q13445 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMED1Q13445 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMED1Q13445 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMED1Q13445 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMED1Q13445 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMED1Q13445 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMED1Q13445 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMED1Q13445 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMED1Q13445 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMED1Q13445 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TMED1Q13445 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMED1Q13445 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMED1Q13445 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMED1Q13445 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMED1Q13445 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMED1Q13445 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMED1Q13445 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMED1Q13445 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMED1Q13445 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMED1Q13445 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMED1Q13445 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMED1Q13445 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMED1Q13445 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMED1Q13445 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMED1Q13445 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMED1Q13445 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMED1Q13445 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMED1Q13445 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMED1Q13445 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMED1Q13445 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMED1Q13445 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMED1Q13445 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
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