Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ECH1Q13011 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
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