Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNMA1Q12791 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNMA1Q12791 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNMA1Q12791 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
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