Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RASGEF1BQ0VAM2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RASGEF1BQ0VAM2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RASGEF1BQ0VAM2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RASGEF1BQ0VAM2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RASGEF1BQ0VAM2 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RASGEF1BQ0VAM2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RASGEF1BQ0VAM2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RASGEF1BQ0VAM2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RASGEF1BQ0VAM2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RASGEF1BQ0VAM2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RASGEF1BQ0VAM2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RASGEF1BQ0VAM2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RASGEF1BQ0VAM2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RASGEF1BQ0VAM2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RASGEF1BQ0VAM2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RASGEF1BQ0VAM2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RASGEF1BQ0VAM2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RASGEF1BQ0VAM2 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RASGEF1BQ0VAM2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RASGEF1BQ0VAM2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RASGEF1BQ0VAM2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RASGEF1BQ0VAM2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RASGEF1BQ0VAM2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RASGEF1BQ0VAM2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RASGEF1BQ0VAM2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RASGEF1BQ0VAM2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RASGEF1BQ0VAM2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RASGEF1BQ0VAM2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RASGEF1BQ0VAM2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RASGEF1BQ0VAM2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RASGEF1BQ0VAM2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RASGEF1BQ0VAM2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RASGEF1BQ0VAM2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RASGEF1BQ0VAM2 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RASGEF1BQ0VAM2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RASGEF1BQ0VAM2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RASGEF1BQ0VAM2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RASGEF1BQ0VAM2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RASGEF1BQ0VAM2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RASGEF1BQ0VAM2 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RASGEF1BQ0VAM2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RASGEF1BQ0VAM2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RASGEF1BQ0VAM2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RASGEF1BQ0VAM2 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RASGEF1BQ0VAM2 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RASGEF1BQ0VAM2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RASGEF1BQ0VAM2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RASGEF1BQ0VAM2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RASGEF1BQ0VAM2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RASGEF1BQ0VAM2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RASGEF1BQ0VAM2 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RASGEF1BQ0VAM2 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RASGEF1BQ0VAM2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RASGEF1BQ0VAM2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RASGEF1BQ0VAM2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RASGEF1BQ0VAM2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RASGEF1BQ0VAM2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RASGEF1BQ0VAM2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RASGEF1BQ0VAM2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RASGEF1BQ0VAM2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RASGEF1BQ0VAM2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RASGEF1BQ0VAM2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RASGEF1BQ0VAM2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms