Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms