Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHRNDQ07001 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHRNDQ07001 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHRNDQ07001 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHRNDQ07001 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHRNDQ07001 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHRNDQ07001 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHRNDQ07001 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHRNDQ07001 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHRNDQ07001 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHRNDQ07001 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHRNDQ07001 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHRNDQ07001 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CHRNDQ07001 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHRNDQ07001 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHRNDQ07001 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHRNDQ07001 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHRNDQ07001 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHRNDQ07001 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHRNDQ07001 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHRNDQ07001 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHRNDQ07001 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHRNDQ07001 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHRNDQ07001 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHRNDQ07001 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHRNDQ07001 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHRNDQ07001 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHRNDQ07001 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHRNDQ07001 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHRNDQ07001 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHRNDQ07001 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHRNDQ07001 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHRNDQ07001 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHRNDQ07001 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHRNDQ07001 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHRNDQ07001 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHRNDQ07001 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHRNDQ07001 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHRNDQ07001 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHRNDQ07001 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHRNDQ07001 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHRNDQ07001 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHRNDQ07001 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHRNDQ07001 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHRNDQ07001 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHRNDQ07001 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHRNDQ07001 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHRNDQ07001 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHRNDQ07001 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHRNDQ07001 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHRNDQ07001 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHRNDQ07001 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHRNDQ07001 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHRNDQ07001 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CHRNDQ07001 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHRNDQ07001 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHRNDQ07001 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHRNDQ07001 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHRNDQ07001 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHRNDQ07001 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHRNDQ07001 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHRNDQ07001 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHRNDQ07001 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHRNDQ07001 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHRNDQ07001 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHRNDQ07001 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHRNDQ07001 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHRNDQ07001 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHRNDQ07001 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHRNDQ07001 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHRNDQ07001 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHRNDQ07001 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHRNDQ07001 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHRNDQ07001 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRNDQ07001 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRNDQ07001 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRNDQ07001 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRNDQ07001 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRNDQ07001 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRNDQ07001 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRNDQ07001 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRNDQ07001 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRNDQ07001 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRNDQ07001 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRNDQ07001 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRNDQ07001 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRNDQ07001 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHRNDQ07001 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHRNDQ07001 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHRNDQ07001 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHRNDQ07001 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHRNDQ07001 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHRNDQ07001 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHRNDQ07001 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHRNDQ07001 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHRNDQ07001 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHRNDQ07001 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHRNDQ07001 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHRNDQ07001 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CHRNDQ07001 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms