Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABPB1Q06547 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms