Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms