Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CALD1Q05682 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms