Protein–RNA interactions for Protein: Q05513

PRKCZ, Protein kinase C zeta type, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCZQ05513 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKCZQ05513 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKCZQ05513 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKCZQ05513 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKCZQ05513 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKCZQ05513 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKCZQ05513 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKCZQ05513 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKCZQ05513 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKCZQ05513 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKCZQ05513 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKCZQ05513 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKCZQ05513 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKCZQ05513 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKCZQ05513 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKCZQ05513 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKCZQ05513 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKCZQ05513 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKCZQ05513 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKCZQ05513 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKCZQ05513 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKCZQ05513 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKCZQ05513 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKCZQ05513 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKCZQ05513 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKCZQ05513 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKCZQ05513 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKCZQ05513 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKCZQ05513 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRKCZQ05513 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRKCZQ05513 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRKCZQ05513 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKCZQ05513 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms