Protein–RNA interactions for Protein: Q03519

TAP2, Antigen peptide transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAP2Q03519 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAP2Q03519 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAP2Q03519 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAP2Q03519 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAP2Q03519 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAP2Q03519 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAP2Q03519 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAP2Q03519 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TAP2Q03519 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAP2Q03519 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAP2Q03519 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TAP2Q03519 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAP2Q03519 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAP2Q03519 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAP2Q03519 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAP2Q03519 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAP2Q03519 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAP2Q03519 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAP2Q03519 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAP2Q03519 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TAP2Q03519 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAP2Q03519 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAP2Q03519 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAP2Q03519 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAP2Q03519 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAP2Q03519 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAP2Q03519 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TAP2Q03519 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAP2Q03519 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAP2Q03519 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAP2Q03519 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAP2Q03519 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAP2Q03519 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAP2Q03519 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAP2Q03519 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAP2Q03519 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAP2Q03519 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAP2Q03519 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAP2Q03519 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAP2Q03519 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAP2Q03519 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TAP2Q03519 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAP2Q03519 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAP2Q03519 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TAP2Q03519 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAP2Q03519 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAP2Q03519 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAP2Q03519 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAP2Q03519 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAP2Q03519 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAP2Q03519 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAP2Q03519 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TAP2Q03519 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TAP2Q03519 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TAP2Q03519 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TAP2Q03519 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TAP2Q03519 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TAP2Q03519 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TAP2Q03519 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TAP2Q03519 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TAP2Q03519 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TAP2Q03519 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TAP2Q03519 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TAP2Q03519 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TAP2Q03519 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TAP2Q03519 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TAP2Q03519 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAP2Q03519 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAP2Q03519 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAP2Q03519 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAP2Q03519 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAP2Q03519 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAP2Q03519 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAP2Q03519 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAP2Q03519 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TAP2Q03519 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAP2Q03519 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAP2Q03519 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAP2Q03519 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAP2Q03519 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAP2Q03519 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAP2Q03519 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAP2Q03519 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAP2Q03519 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAP2Q03519 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAP2Q03519 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAP2Q03519 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TAP2Q03519 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAP2Q03519 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAP2Q03519 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAP2Q03519 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAP2Q03519 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAP2Q03519 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAP2Q03519 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAP2Q03519 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAP2Q03519 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAP2Q03519 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAP2Q03519 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAP2Q03519 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAP2Q03519 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms