Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ID3Q02535 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ID3Q02535 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ID3Q02535 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ID3Q02535 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ID3Q02535 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ID3Q02535 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ID3Q02535 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ID3Q02535 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ID3Q02535 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ID3Q02535 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ID3Q02535 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ID3Q02535 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ID3Q02535 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ID3Q02535 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ID3Q02535 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ID3Q02535 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ID3Q02535 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ID3Q02535 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ID3Q02535 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ID3Q02535 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ID3Q02535 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ID3Q02535 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ID3Q02535 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ID3Q02535 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ID3Q02535 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ID3Q02535 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ID3Q02535 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ID3Q02535 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ID3Q02535 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ID3Q02535 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ID3Q02535 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ID3Q02535 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ID3Q02535 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ID3Q02535 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ID3Q02535 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ID3Q02535 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ID3Q02535 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ID3Q02535 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ID3Q02535 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ID3Q02535 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ID3Q02535 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ID3Q02535 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ID3Q02535 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ID3Q02535 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ID3Q02535 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ID3Q02535 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ID3Q02535 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ID3Q02535 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ID3Q02535 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ID3Q02535 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ID3Q02535 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
ID3Q02535 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ID3Q02535 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ID3Q02535 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ID3Q02535 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ID3Q02535 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ID3Q02535 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ID3Q02535 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ID3Q02535 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ID3Q02535 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ID3Q02535 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ID3Q02535 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ID3Q02535 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ID3Q02535 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ID3Q02535 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ID3Q02535 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ID3Q02535 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ID3Q02535 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ID3Q02535 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ID3Q02535 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ID3Q02535 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ID3Q02535 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ID3Q02535 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ID3Q02535 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ID3Q02535 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ID3Q02535 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ID3Q02535 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ID3Q02535 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ID3Q02535 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ID3Q02535 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ID3Q02535 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ID3Q02535 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ID3Q02535 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ID3Q02535 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ID3Q02535 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ID3Q02535 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ID3Q02535 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ID3Q02535 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ID3Q02535 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ID3Q02535 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ID3Q02535 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ID3Q02535 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ID3Q02535 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ID3Q02535 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ID3Q02535 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ID3Q02535 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ID3Q02535 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ID3Q02535 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ID3Q02535 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms