Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
APBA1Q02410 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APBA1Q02410 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
APBA1Q02410 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APBA1Q02410 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APBA1Q02410 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APBA1Q02410 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APBA1Q02410 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APBA1Q02410 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APBA1Q02410 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APBA1Q02410 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APBA1Q02410 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APBA1Q02410 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APBA1Q02410 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APBA1Q02410 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APBA1Q02410 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APBA1Q02410 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APBA1Q02410 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APBA1Q02410 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APBA1Q02410 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APBA1Q02410 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APBA1Q02410 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APBA1Q02410 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APBA1Q02410 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APBA1Q02410 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
APBA1Q02410 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APBA1Q02410 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APBA1Q02410 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
APBA1Q02410 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APBA1Q02410 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APBA1Q02410 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APBA1Q02410 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APBA1Q02410 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APBA1Q02410 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APBA1Q02410 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APBA1Q02410 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APBA1Q02410 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APBA1Q02410 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APBA1Q02410 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APBA1Q02410 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
APBA1Q02410 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APBA1Q02410 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APBA1Q02410 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APBA1Q02410 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APBA1Q02410 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APBA1Q02410 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APBA1Q02410 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
APBA1Q02410 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APBA1Q02410 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APBA1Q02410 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APBA1Q02410 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APBA1Q02410 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APBA1Q02410 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APBA1Q02410 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APBA1Q02410 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APBA1Q02410 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APBA1Q02410 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APBA1Q02410 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
APBA1Q02410 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APBA1Q02410 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APBA1Q02410 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APBA1Q02410 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APBA1Q02410 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APBA1Q02410 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APBA1Q02410 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
APBA1Q02410 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APBA1Q02410 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APBA1Q02410 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APBA1Q02410 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APBA1Q02410 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APBA1Q02410 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APBA1Q02410 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APBA1Q02410 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APBA1Q02410 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APBA1Q02410 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APBA1Q02410 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APBA1Q02410 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APBA1Q02410 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APBA1Q02410 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APBA1Q02410 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APBA1Q02410 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APBA1Q02410 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms