Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms