Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK5Q00535 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms