Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZBED6P86452 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZBED6P86452 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms