Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IRX3P78415 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IRX3P78415 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IRX3P78415 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IRX3P78415 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IRX3P78415 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
IRX3P78415 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IRX3P78415 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IRX3P78415 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IRX3P78415 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IRX3P78415 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IRX3P78415 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IRX3P78415 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IRX3P78415 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IRX3P78415 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IRX3P78415 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IRX3P78415 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IRX3P78415 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IRX3P78415 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IRX3P78415 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IRX3P78415 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IRX3P78415 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IRX3P78415 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IRX3P78415 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
IRX3P78415 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
IRX3P78415 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IRX3P78415 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IRX3P78415 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IRX3P78415 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IRX3P78415 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IRX3P78415 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IRX3P78415 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IRX3P78415 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IRX3P78415 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IRX3P78415 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IRX3P78415 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IRX3P78415 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IRX3P78415 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IRX3P78415 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IRX3P78415 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
IRX3P78415 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IRX3P78415 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IRX3P78415 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IRX3P78415 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
IRX3P78415 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IRX3P78415 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IRX3P78415 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IRX3P78415 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IRX3P78415 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
IRX3P78415 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IRX3P78415 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IRX3P78415 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
IRX3P78415 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IRX3P78415 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IRX3P78415 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IRX3P78415 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IRX3P78415 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IRX3P78415 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IRX3P78415 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IRX3P78415 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IRX3P78415 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IRX3P78415 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IRX3P78415 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IRX3P78415 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IRX3P78415 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IRX3P78415 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IRX3P78415 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
IRX3P78415 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IRX3P78415 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IRX3P78415 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IRX3P78415 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IRX3P78415 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IRX3P78415 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IRX3P78415 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IRX3P78415 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IRX3P78415 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IRX3P78415 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IRX3P78415 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
IRX3P78415 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IRX3P78415 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IRX3P78415 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IRX3P78415 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IRX3P78415 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IRX3P78415 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IRX3P78415 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
IRX3P78415 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IRX3P78415 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IRX3P78415 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IRX3P78415 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IRX3P78415 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IRX3P78415 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IRX3P78415 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IRX3P78415 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IRX3P78415 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IRX3P78415 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRX3P78415 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRX3P78415 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRX3P78415 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRX3P78415 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRX3P78415 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms